El Director Ejecutivo del EUNACOM está encargado de establecer los lineamientos generales del examen, de definir su diseño e implementación y de la publicación de sus resultados. Es responsable de conformar el equipo técnico, de la vocería del examen y de representarlo ante las instituciones con las que colabora. En particular, es responsable del desarrollo permanente del EUNACOM, para lo cual cuenta con la asesoría técnica del Consejo Estadístico. Responde al Presidente de ASOFAMECH para su gestión y al Directorio de EUNACOM en los aspectos financieros, de publicidad de resultados y de modificaciones en el cálculo de los mismos.
El Sub Director del EUNACOM está a cargo de los aspectos operativos y administrativos del examen, para lo cuál cuenta con un equipo de coordinación.